Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTY5

CBWD3, COBW domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD3Q5JTY5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBWD3Q5JTY5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBWD3Q5JTY5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms