Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZC3H12AQ5D1E8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms