Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSP90AB4PQ58FF6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSP90AB4PQ58FF6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSP90AB4PQ58FF6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms