Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PAN3Q58A45 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PAN3Q58A45 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms