Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF394Q53GI3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms