Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKDCCQ504Y2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDCCQ504Y2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms