Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM259Q4ZIN3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM259Q4ZIN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms