Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01620Q4KN68 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms