Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CFAP221Q4G0U5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP221Q4G0U5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms