Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCB5Q2M3G0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB5Q2M3G0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms