Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IMPG1Q17R60 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms