Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPP1Q16831 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPP1Q16831 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms