Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NREPQ16612 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NREPQ16612 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NREPQ16612 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NREPQ16612 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NREPQ16612 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NREPQ16612 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms