Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS72Q15906 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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VPS72Q15906 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS72Q15906 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
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