Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIP11Q15643 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP11Q15643 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms