Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF11Q15544 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms