Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SIX1Q15475 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SIX1Q15475 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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