Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RABEP1Q15276 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABEP1Q15276 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
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