Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PDCD1Q15116 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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