Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SHPRHQ149N8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SHPRHQ149N8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
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