Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKP1Q13835 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms