Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3CQ13748 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3CQ13748 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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