Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALCAMQ13740 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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