Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CUL3Q13618 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUL3Q13618 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUL3Q13618 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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