Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TUBB3Q13509 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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