Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNTA1Q13424 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SNTA1Q13424 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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