Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PMS2P3Q13401 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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PMS2P3Q13401 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PMS2P3Q13401 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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