Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF1Q13351 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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