Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SCGB2A2Q13296 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SCGB2A2Q13296 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SCGB2A2Q13296 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SCGB2A2Q13296 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SCGB2A2Q13296 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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