Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CALCOCO2Q13137 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CALCOCO2Q13137 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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