Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RESTQ13127 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RESTQ13127 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RESTQ13127 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RESTQ13127 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RESTQ13127 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RESTQ13127 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RESTQ13127 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RESTQ13127 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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