Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRN3Q13033 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRN3Q13033 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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