Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 YCR064CYCR064C 411 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YDR161WYDR161W 1164 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 GRX2YDR513W 432 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 CGR1YGL029W 363 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YGR219WYGR219W 342 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 MBB1YJL199C 327 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YAR075WYAR075W 474 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 ALG14YBR070C 714 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 SSN2YDR443C 4263 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 TRS130YMR218C 3309 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 SEC16YPL085W 6588 nt2.52□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 MIP6YHR015W 1980 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YCK2YNL154C 1641 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 BSC2YDR275W 708 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 VMA5YKL080W 1179 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YLR444CYLR444C 303 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 AAH1YNL141W 1044 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 MFA2YNL145W 117 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 RFM1YOR279C 933 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YPL276WYPL276W 438 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 MSB1YOR188W 3414 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 ACA1YER045C 1470 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YPK1YKL126W 2043 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 FAR11YNL127W 2862 nt2.51□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PST1YDR055W 1335 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 SUL1YBR294W 2580 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 RTN1YDR233C 888 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YIL089WYIL089W 618 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 ERG20YJL167W 1059 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 GPI14YJR013W 1212 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 USB1YLR132C 873 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YMR187CYMR187C 1296 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PFK27YOL136C 1194 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 CAT5YOR125C 702 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PDR11YIL013C 4236 nt2.5□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 RPN4YDL020C 1596 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PBI1YPL272C 1554 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 ABD1YBR236C 1311 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 LSM6YDR378C 261 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PRP18YGR006W 756 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PEX4YGR133W 552 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YLR225CYLR225C 1224 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 RPS29AYLR388W 171 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 SSD1YDR293C 3753 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 STE24YJR117W 1362 nt2.49□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 VIP1YLR410W 3441 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 MRP10YDL045W-A 288 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PCL9YDL179W 915 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 THO1YER063W 657 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YKR070WYKR070W 1059 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PRE8YML092C 753 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 CSF1YLR087C 8877 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 NEW1YPL226W 3591 nt2.48□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 TOF1YNL273W 3717 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 PDR3YBL005W 2931 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 EMC6YLL014W 327 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YOL050CYOL050C 321 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 RPL25YOL127W 429 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 CBP6YBR120C 489 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 TAE2YPL009C 3117 nt2.47□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 YDL199CYDL199C 2064 nt2.46□□□□□ -2.01
RIO1Q12196 EMC2YJR088C 879 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 YMR310CYMR310C 954 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 YOR263CYOR263C 408 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 SUR1YPL057C 1149 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 DAD3YBR233W-A 285 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 OSW7YFR039C 1533 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 VHR1YIL056W 1923 nt2.46□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 SNX41YDR425W 1878 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 TMN3YER113C 2121 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 YOR365CYOR365C 2112 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 MSS4YDR208W 2340 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 PMI40YER003C 1290 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 RNH203YLR154C 333 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 PFY1YOR122C 381 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 CAF20YOR276W 486 nt2.45□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 RSM26YJR101W 801 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 REX3YLR107W 1215 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 DSE3YOR264W 1293 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 SPS4YOR313C 1017 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 RFC5YBR087W 1065 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 PIN4YBL051C 2007 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 INO80YGL150C 4470 nt2.44□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 YDR355CYDR355C 303 nt2.43□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 MMS21YEL019C 804 nt2.43□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 AIM11YER093C-A 414 nt2.43□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 YER147C-AYER147C-A 411 nt2.43□□□□□ -2.02
RIO1Q12196 MTM1YGR257C 1101 nt2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17 ms