Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAGPQ0VAQ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms