Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA1Q09470 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA1Q09470 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms