Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACSM2AQ08AH3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms