Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 IME1YJR094C 1083 nt3.34□□□□□ -1.87
FMP40Q08968 COX19YLL018C-A 297 nt3.34□□□□□ -1.87
FMP40Q08968 RNH203YLR154C 333 nt3.34□□□□□ -1.87
FMP40Q08968 RPL6BYLR448W 531 nt3.34□□□□□ -1.87
FMP40Q08968 OSH3YHR073W 2991 nt3.34□□□□□ -1.87
FMP40Q08968 ARG5,6YER069W 2592 nt3.34□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 NOP56YLR197W 1515 nt3.34□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 DAN4YJR151C 3486 nt3.34□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RAD5YLR032W 3510 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TRS120YDR407C 3870 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 CDC45YLR103C 1953 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RSC1YGR056W 2787 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YCR085WYCR085W 354 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 ECO1YFR027W 846 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TAD1YGL243W 1203 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YHR054CYHR054C 1065 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 AIM18YHR198C 966 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YJR020WYJR020W 333 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 ATG10YLL042C 504 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YLR416CYLR416C 399 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 PEX6YNL329C 3093 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 HRD1YOL013C 1656 nt3.33□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TAF1YGR274C 3201 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 VPS33YLR396C 2076 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YAK1YJL141C 2424 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YGR039WYGR039W 312 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YKL123WYKL123W 381 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 GTT2YLL060C 702 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RPS28BYLR264W 204 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YNR025CYNR025C 360 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YBR063CYBR063C 1215 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 AGE1YDR524C 1449 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 VPS17YOR132W 1656 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YPR022CYPR022C 3402 nt3.32□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 NUR1YDL089W 1455 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RTT109YLL002W 1311 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RIM1YCR028C-A 408 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 HMO1YDR174W 741 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YDR271CYDR271C 372 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 SMX2YFL017W-A 234 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 PGD1YGL025C 1194 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 LIN1YHR156C 1023 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 CDC8YJR057W 651 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 VMA5YKL080W 1179 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YBR053CYBR053C 1077 nt3.31□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 ATP25YMR098C 1839 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 MDM36YPR083W 1740 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 AAD3YCR107W 1092 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 NSE4YDL105W 1209 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 LOC1YFR001W 615 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 AIM19YIL087C 474 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 SGN1YIR001C 753 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YJL147CYJL147C 1149 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TMA19YKL056C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 ATP11YNL315C 957 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 INO4YOL108C 456 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YOR387CYOR387C 621 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TPO5YKL174C 1857 nt3.3□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 MTR4YJL050W 3222 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 GPI13YLL031C 3054 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 CDC40YDR364C 1368 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 VPS53YJL029C 2469 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 KRE2YDR483W 1329 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TRX3YCR083W 384 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 SLU7YDR088C 1149 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YDR248CYDR248C 582 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 PEX10YDR265W 1014 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 THO1YER063W 657 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YGR073CYGR073C 372 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YHR180WYHR180W 492 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RNR2YJL026W 1200 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 PIR1YKL164C 1026 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TPK3YKL166C 1197 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YOL114CYOL114C 609 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YPR053CYPR053C 456 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 LTP1YPR073C 486 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 snR35snR35 204 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YCL007CYCL007C 393 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 REF2YDR195W 1602 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 SPT10YJL127C 1923 nt3.29□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 SRP68YPL243W 1800 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 CIN1YOR349W 3045 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 MRPL11YDL202W 750 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RAV2YDR202C 1056 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YIR040CYIR040C 333 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YKL069WYKL069W 543 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 PRM6YML047C 1059 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 PEX11YOL147C 711 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 GCY1YOR120W 939 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 RRP15YPR143W 753 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YPR153WYPR153W 423 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 CMD1YBR109C 444 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 YCL002CYCL002C 792 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 MSD1YPL104W 1977 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 TFC1YBR123C 1950 nt3.28□□□□□ -1.88
FMP40Q08968 SSE2YBR169C 2082 nt3.28□□□□□ -1.89
FMP40Q08968 SSM4YIL030C 3960 nt3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.1 ms