Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 PMR1YGL167C 2853 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 KAR5YMR065W 1515 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 RRI1YDL216C 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 KEG1YFR042W 603 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PEX21YGR239C 867 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 CTL1YMR180C 963 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YNL203CYNL203C 612 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 MUM2YBR057C 1101 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PDR3YBL005W 2931 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SIR3YLR442C 2937 nt2.79□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 GYP7YDL234C 2241 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 ATG13YPR185W 2217 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SAK1YER129W 3429 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 BCK1YJL095W 4437 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 AI2Q0055 2565 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 ORC2YBR060C 1863 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 ARF1YDL192W 546 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 LAC1YKL008C 1257 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YAL069WYAL069W 315 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SED5YLR026C 1023 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YML037CYML037C 1023 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 MSN1YOL116W 1149 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YPL107WYPL107W 747 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 ERG11YHR007C 1593 nt2.78□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 RIT1YMR283C 1542 nt2.78□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 VHR1YIL056W 1923 nt2.78□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 HBT1YDL223C 3141 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RIF1YBR275C 5751 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 ESL1YIL151C 3357 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YCR015CYCR015C 954 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 snR78snR78 87 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 TCD1YHR003C 1290 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YHR022CYHR022C 771 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 ERV41YML067C 1059 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 BAG7YOR134W 1230 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SSP2YOR242C 1116 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 HSH49YOR319W 642 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RRD2YPL152W 1077 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 ATG29YPL166W 642 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SWD3YBR175W 948 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 GRX1YCL035C 333 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SLN1YIL147C 3663 nt2.77□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 CLG1YGL215W 1359 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 KRE33YNL132W 3171 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RDI1YDL135C 609 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RRG1YDR065W 1098 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR355CYDR355C 303 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 AST2YER101C 1293 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YIL054WYIL054W 318 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YJR056CYJR056C 711 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RPS29AYLR388W 171 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 VMA6YLR447C 1038 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RUF20RUF20 443 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YNL043CYNL043C 321 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RLI1YDR091C 1827 nt2.76□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 TFC4YGR047C 3078 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YCL019WYCL019W 5313 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RED1YLR263W 2484 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 MPC3YGR243W 441 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 MRPL38YKL170W 417 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YLR339CYLR339C 552 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 VAM3YOR106W 852 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 FAR11YNL127W 2862 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 RIM13YMR154C 2184 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 SUL1YBR294W 2580 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 CYR1YJL005W 6081 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 MSA1YOR066W 1890 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 CEP3YMR168C 1827 nt2.75□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 CTH1YDR151C 978 nt2.74□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 VMA5YKL080W 1179 nt2.74□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YPR142CYPR142C 564 nt2.74□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 ESC1YMR219W 4977 nt2.74□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 PRP8YHR165C 7242 nt2.74□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YPL150WYPL150W 2706 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 PEX6YNL329C 3093 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YER138CYER138C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YER160CYER160C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YJR027WYJR027W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YML039WYML039W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YML045WYML045W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YMR050CYMR050C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
CLP1Q08685 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
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