Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 BSC3YLR465C 309 nt4.58□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 AIM4YBR194W 372 nt4.58□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 TRF5YNL299W 1929 nt4.58□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 UBP6YFR010W 1500 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 CDC6YJL194W 1542 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 SUP35YDR172W 2058 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 GDI1YER136W 1356 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 THP1YOL072W 1368 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 CUE2YKL090W 1332 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 ERV1YGR029W 570 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 VMA10YHR039C-A 345 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 NIT2YJL126W 924 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 VPS63YLR261C 327 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YMR141CYMR141C 309 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 UBP10YNL186W 2379 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 DSL1YNL258C 2265 nt4.57□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 STE7YDL159W 1548 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 SEC27YGL137W 2670 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PMI40YER003C 1290 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YFL015CYFL015C 495 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 LIF1YGL090W 1266 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YGR017WYGR017W 894 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 MAM33YIL070C 801 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YAL065CYAL065C 387 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 ERG3YLR056W 1098 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 SIW14YNL032W 846 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YPL107WYPL107W 747 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YMR102CYMR102C 2505 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 DAL5YJR152W 1632 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 RPN3YER021W 1572 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 TPO5YKL174C 1857 nt4.56□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 SWC4YGR002C 1431 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 WHI3YNL197C 1986 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 ATP5YDR298C 639 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 GPP2YER062C 753 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YFL068WYFL068W 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 RMR1YGL250W 726 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 CFD1YIL003W 882 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YJL169WYJL169W 369 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 ABM1YJR108W 372 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 MCM22YJR135C 720 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PDP3YLR455W 915 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YPT53YNL093W 663 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 VPS27YNR006W 1869 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PAM1YDR251W 2493 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 RSC3YDR303C 2658 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PTR3YFR029W 2037 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 OST1YJL002C 1431 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 BOI2YER114C 3123 nt4.55□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 FUI1YBL042C 1920 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PAH1YMR165C 2589 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 DPB4YDR121W 591 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YDR149CYDR149C 708 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 SLD5YDR489W 885 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 ROX1YPR065W 1107 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PHO87YCR037C 2772 nt4.54□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 MET12YPL023C 1974 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YGL039WYGL039W 1047 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YGL088WYGL088W 366 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 RAD27YKL113C 1149 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 BUD28YLR062C 378 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 RIO2YNL207W 1278 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 PDR17YNL264C 1053 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 YOR282WYOR282W 321 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 TRS85YDR108W 2097 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 SEC2YNL272C 2280 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 AXL2YIL140W 2472 nt4.53□□□□□ -1.68
AVO1Q08236 STE24YJR117W 1362 nt4.53□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 YJL206CYJL206C 2277 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 HAA1YPR008W 2085 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 snR59snR59 78 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 MFA1YDR461W 111 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 SEC53YFL045C 765 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 RGI2YIL057C 495 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 YKL069WYKL069W 543 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 YOR203WYOR203W 354 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 YOR331CYOR331C 558 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 SHG1YBR258C 429 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 TAF7YMR227C 1773 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 DSN1YIR010W 1731 nt4.52□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 BUD6YLR319C 2367 nt4.51□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 SRS2YJL092W 3525 nt4.51□□□□□ -1.69
AVO1Q08236 URC2YDR520C 2319 nt4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11 ms