Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TFF3Q07654 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TFF3Q07654 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms