Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABPB1Q06547 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABPB1Q06547 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms