Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms