Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKCDQ05655 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRKCDQ05655 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms