Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms