Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TOP2BQ02880 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TOP2BQ02880 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms