Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL6Q02878 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL6Q02878 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms