Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 VIP1YLR410W 3441 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YDR239CYDR239C 2364 nt2.37□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 HYP2YEL034W 474 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 PMI40YER003C 1290 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YJR056CYJR056C 711 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YBL094CYBL094C 333 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MSN1YOL116W 1149 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 THI80YOR143C 960 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SWD3YBR175W 948 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YHR078WYHR078W 1659 nt2.36□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YKU80YMR106C 1890 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YDR535CYDR535C 501 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 BAT1YHR208W 1182 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SNX4YJL036W 1272 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MBB1YJL199C 327 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YAL069WYAL069W 315 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MST28YAR033W 705 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 VMA6YLR447C 1038 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YOR055WYOR055W 435 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 CAF20YOR276W 486 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SUR1YPL057C 1149 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 ACM1YPL267W 630 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SMY2YBR172C 2223 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 DUN1YDL101C 1542 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SPH1YLR313C 1593 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SPF1YEL031W 3648 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 TRM12YML005W 1389 nt2.35□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SKO1YNL167C 1944 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 AVT2YEL064C 1443 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YDR355CYDR355C 303 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 RPB9YGL070C 369 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YGR073CYGR073C 372 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 REX3YLR107W 1215 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 PSY3YLR376C 729 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SPC24YMR117C 642 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 SAS2YMR127C 1017 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 VPS28YPL065W 729 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 YBR209WYBR209W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 MUS81YDR386W 1899 nt2.34□□□□□ -2.03
NUP49Q02199 CSF1YLR087C 8877 nt2.34□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 VHR1YIL056W 1923 nt2.34□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 TOP2YNL088W 4287 nt2.34□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SVL3YPL032C 2478 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RLI1YDR091C 1827 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 EPT1YHR123W 1176 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 MRPS17YMR188C 714 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RRG7YOR305W 729 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YPL035CYPL035C 348 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 PAF1YBR279W 1338 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 PDR1YGL013C 3207 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YBT1YLL048C 4986 nt2.33□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 FRE8YLR047C 2061 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 IKI3YLR384C 4050 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 LRS4YDR439W 1044 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 IRC6YFR043C 714 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 BET3YKR068C 582 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RPS1AYLR441C 768 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RAD10YML095C 633 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YBL028CYBL028C 321 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RRD2YPL152W 1077 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 RDS2YPL133C 1341 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YER138CYER138C 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YER160CYER160C 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YJR027WYJR027W 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YML039WYML039W 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YML045WYML045W 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YMR050CYMR050C 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YML096WYML096W 1578 nt2.32□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SWR1YDR334W 4545 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 ISW1YBR245C 3390 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 MON1YGL124C 1935 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YEL075CYEL075C 369 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YHR213WYHR213W 597 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 SGM1YJR134C 2124 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 DID4YKL002W 699 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YAR062WYAR062W 597 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 JID1YPR061C 906 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 PIS1YPR113W 663 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YNL011CYNL011C 1335 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 YJL132WYJL132W 2253 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 TCB2YNL087W 3537 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 DUG2YBR281C 2637 nt2.31□□□□□ -2.04
NUP49Q02199 ORC2YBR060C 1863 nt2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20 ms