Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEFA6Q01524 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA6Q01524 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms