Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDE1BQ01064 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE1BQ01064 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms