Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK16Q00536 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK16Q00536 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK16Q00536 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms